Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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