Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 1810059H22Rik-201ENSMUST00000203249 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Nbdy-206ENSMUST00000208373 1061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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