Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb3Q6XAS4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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