Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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