Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms