Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp200Q6P4T2 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms