Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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