Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms