Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms