Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc21bQ0HA38 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms