Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox8Q04886 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms