Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms