Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm29617-201ENSMUST00000185730 610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms