Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Otx1P80205 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms