Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms