Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cspp1-201ENSMUST00000071087 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms