Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp5bP56480 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp5bP56480 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms