Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt6aP50446 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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