Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtpreP49446 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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