Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VdrP48281 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VdrP48281 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms