Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms