Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd9P40240 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms