Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ddias-201ENSMUST00000032877 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm14686-201ENSMUST00000119926 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm5696-201ENSMUST00000189850 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 S100a10-201ENSMUST00000045756 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ccdc146-201ENSMUST00000030552 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm28905-202ENSMUST00000219328 1377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 AC122858.2-201ENSMUST00000228571 1362 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm23820-201ENSMUST00000158450 300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 1810007D17Rik-201ENSMUST00000187629 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm42871-201ENSMUST00000199333 315 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Mfap5-202ENSMUST00000118626 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Chd1P40201 Gm15499-201ENSMUST00000141390 422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Chd1P40201 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Chd1P40201 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Chd1P40201 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Chd1P40201 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chd1P40201 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Fank1-202ENSMUST00000121560 475 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Car1-203ENSMUST00000181860 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 AC159244.2-201ENSMUST00000222051 220 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Cox6c-201ENSMUST00000014457 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chd1P40201 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms