Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms