Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RxraP28700 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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