Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms