Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.88
P20040 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P20040 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P20040 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P20040 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P20040 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P20040 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P20040 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P20040 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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