Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18532 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18532 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms