Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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H2-Eb1P04230 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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