Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3239L7N2D9 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3239L7N2D9 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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