Protein–RNA interactions for Protein: L7N296

Gm3739, Predicted gene 3739, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3739L7N296 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3739L7N296 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms