Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms