Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnksr1A2A9K7 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms