Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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