Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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