Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ubl3Q9Z2M6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms