Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tlr5Q9JLF7 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms