Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ccdc97Q9DBT3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ccdc97Q9DBT3 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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