Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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