Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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