Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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