Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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