Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms