Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms