Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cwc22Q8C5N3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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