Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac7Q8C2B3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hdac7Q8C2B3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hdac7Q8C2B3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Hdac7Q8C2B3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hdac7Q8C2B3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hdac7Q8C2B3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hdac7Q8C2B3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Hdac7Q8C2B3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hdac7Q8C2B3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Hdac7Q8C2B3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Hdac7Q8C2B3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms