Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms