Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms