Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q8BGC1 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms