Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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ChfrQ810L3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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